Aydos Müzesi’nin en ilgi çekici tarafı, kalenin geçmişini anlatırken doğrudan kazılarda ortaya çıkarılan eserleri kullanması. Sergide taşıyıcı sütunlar ve kaideler, kapı ve pencere kenarlarında kullanılan profilli taşlar, kemer parçaları, kabartmalı süsleme levhaları, korkuluk panoları, demir kenetli taşlar ve su akarlığı parçaları bulunuyor. Özellikle Erken ve Orta Bizans dönemlerine tarihlenen bu parçalar, kalenin yalnızca bir savunma yapısı olmadığını; dönemin mimari anlayışı ve taş işçiliği hakkında da önemli bilgiler verdiğini gösteriyor. Üstelik müze, yalnızca vitrinlere eser koyup bırakmıyor. Kalede yürütülen 12 yıllık restorasyon sürecinin farklı aşamalarını gösteren fotoğraflar ve kalenin tarihini anlatan video gösterimleri de ziyaretçilere sunuluyor. Böylece bugün görülen kalenin nasıl ortaya çıkarıldığını da görmek mümkün.