Hasankeyf, 640 yılında İslam ordusu tarafından ele geçirilerek Emeviler, Abbasiler, Hamdaniler ve Mervaniler gibi halifelik ve beyliklerin egemenliğinde kalmıştır. 1102 yılında ise Artuklular hakimiyeti kazanmışlardır. Böylelikle Hasankeyf, 1102-1232 yılları arasında Artuklu Beyliği’ne başkentlik yapmıştır. Bu dönemde önemli ticari ve bilim merkezi haline gelerek zirve dönemini yaşamıştır. Ayrıca ünlü bilim insanı olan El-Cezeri, yaklaşık 50 mekanik cihaz gibi tasarladığı ve inşa ettiği kritik çalışmalarını bu dönemde gerçekleştirmiştir. Hasankeyf, Artuklulardan sonra Eyyübiler, Akkoyunlular ve Safeviler tarafından yönetilmiştir. Her biri kendine özgü izlerini bırakmıştır. 1515 tarihinde ise Osmanlı topraklarına katılarak kültürel mirasını önemli ölçüde korumuştur.