Meyve Sineği, özellikle vahşi tip, sarı-kahverengi bir vücuda sahiptir. Karın bölgesinde siyah halkalar bulunur - bu özelliği türün adı melanogaster ya da "kara karınlı" olarak tanınmasına yol açar. Bu sinekler, kendine özgü tuğla kırmızısı gözleriyle tanınır. Cinsel dimorfizm belirgindir; erkekler biraz daha küçük ve daha koyu sırt gösterirler.