Ilısu Barajı’nın yapımından sonra, Hasankeyf’in sular altında kalan büyük bir bölümü için kapsamlı bir arkeolojik çalışma bulunmamaktadır. Ancak, varlığı bilinen bazı kalıntılar mevcuttur. Antik köprü kalıntıları, sualtı araştırmaları için kilit bir nokta oluşturmaktadır. Hasankeyf’in en özgün niteliği olan binlerce mağara da sular altında kalarak içerisinde hala keşfedilmemiş eserlerin olabileceği göz önünde bulundurulmaktadır. Tarihi çarşılar ve evler de göl tabanında yer almaktadır. Bu yapılar, dönemin sosyo-ekonomik yapısı hakkında kayda değer bilgiler sunabilmektedir. Su altında kalan alanlarda farklı dönemlere ait mezarlar da bulunmaktadır. Baraj yapımı sürecinde bu mezarların bir kısmının taşındığı bilinmektedir. Geride kalanlar ise su altı arkeolojisi için önemli bir keşif kaynağı olmuştur.