Bu tropikal penguen, Galápagos Adaları'na endemiktir ve bu kadar kuzeyde yaşayan tek penguen türüdür. Daha sıcak iklimlerde hayatta kalma, uyum sağlama ve zamanlarının çoğunu suda geçirmektedirler. Bu neslin tehlike altında okyanus sınırının karşı karşıya olduğu en büyük tehdit iklim değişikliğidir. Galápagos pengueni, son yıllarda özellikle El Niño sırasında sıcaklık dalgalanmaya başlayan Humboldt akıntısına büyük ölçüde dayanır. 1982-1983 yıllarında Galápagos penguen popülasyonunun %77'si öldü ve sadece 15 yıl sonra bir başka El Niño olayıyla tekrar tehdit altına girdiler. Bu aşırı sıcaklık değişimleri giderek daha sık yaşanıyor ve bu durum Galápagos penguenini en tehlike altındaki deniz hayvanlarından biri haline getiriyor.