1. Murad tarafından 1300’lü yıllarda yaptırılan cami, Osmanlı mimarisinde alt katı cami, üst katı medrese olan tek yapı olma özelliğine sahip. Mimari açıdan Gotik, Selçuklu, Bizans ve erken Osmanlı özelliklerini barındıran yapının kim tarafından yapıldığı bilinmiyor. Hüdavendigar Külliyesi’nin türbesi 1854 yılında deprem sebebi ile tamamen yıkılmış, daha sonra yerine yenisi inşa edilmiş. Cık Cık (Gir-Çık) hamamı medrese öğrencilerinin ihtiyaçları için kullanılmaktaymış. Diğer külliye hamamlarına oranla küçük bir hamam olması yakınlardaki Eski Kaplıca’nın da kullanıldığına işaret ediyor olabilir.